Scantox社は、極めて稀な変異を検出するとともに、変異シグネチャを解析するための高度なエラー補正シーケンシング技術を提供しています。DuplexSeq™は、変異頻度、スペクトル、およびメカニズムに関する知見を提供し、情報に基づいた安全性判断を支援します。
サービス情報
DuplexSeq™は、二重シーケンシング技術を用いてDNAの両鎖を個別に追跡することで、従来の手法では真の変異と区別できないシーケンシングエラーを排除します。これにより、1,000万塩基あたり1未満というエラー率で、極めて稀な変異の検出が可能になります。
この技術により、変異頻度、変異スペクトル、およびトリヌクレオチドシグネチャが得られ、これらを既知の発がんパターン（COSMICデータベースなど）と比較することで、作用機序の解明を支援します。野生型の動物および高品質なDNAが得られるあらゆる組織源で利用可能です。
DuplexSeq™で、変異頻度以上の情報を解明
ワークフローに合わせて柔軟に対応
ラボ向けの試薬キットから、初期創薬から規制当局への提出準備までを網羅するCROサービスまで、幅広くご提供します。既存の毒性試験プログラムに統合可能なアッセイプラットフォームもご用意しています。
ゲノム安全性エンドポイントを追加
高品質なDNAを含むあらゆる組織由来のサンプルに対して、エラー補正シーケンシングを適用します。野生型動物および標準的な組織タイプ（既存の研究から得られた保存サンプルを含む）を使用します。
サンプルから知見へ
自動レポート機能を備えたクラウド型バイオインフォマティクス・ワークフロー。お客様がサンプルをお送りいただければ、規制当局への提出準備が整ったデータをお届けします。
変異頻度を超えて
変異スペクトルやシグネチャは、メカニズムに関する文脈を提供することで、リスク評価を強化し、規制戦略の策定に資する。
DuplexSeq™ 変異導入アッセイについて詳しく知りたい方は、先日のウェビナーのアーカイブをご覧ください。
DuplexSeq™ を安全評価戦略にどう組み込むか
Scantoxは、初期スクリーニングからOECDガイドラインに基づくGLP試験に至るまで、包括的な遺伝毒性試験サービスを提供しています。DuplexSeq™変異原性試験は、作用機序、組織特異性、あるいは用量反応関係の解明が必要な場合に、証拠の重み（weight-of-evidence）に基づく評価を強化する分子レベルのエンドポイントを追加します。
1. エイムス陽性時の経過観察計画
開発段階でエイムズ試験の結果が陽性となった場合、プロジェクトが頓挫する恐れがあります。この重大な変異原性の懸念に対処するには、その関連性を評価し、ヒトを対象とした第I相臨床試験に先立って、確固たる追跡試験を実施するための体系的なアプローチが必要です。 DuplexSeq™ 突然変異誘発アッセイは、Big Blue® トランスジェニック齧歯類遺伝子突然変異アッセイと併せて活用することで、包括的なフォローアップ戦略の一環として、突然変異の特性評価や組織特異的なデータの取得を可能にします。
2. ニトロソアミンおよびNDSRI不純物のリスク評価
ニトロソアミン不純物の評価には、ベンチマーク用量（BMD）モデリングに適した生体内変異頻度データが頻繁に必要とされます。DuplexSeq™ 技術の高い感度は、規制当局のOECD 488 Big Blue®試験と並行して導出される、信頼性の高い許容摂取量（AI）基準値の策定を支援するのに理想的です。 DuplexSeq™変異原性試験は、標準的な毒性試験の組織から生体内変異頻度データを生成するだけでなく、変異スペクトルやメカニズムに関する知見という付加価値も提供します。
注：N-ニトロソアミン類の初期検査手法としては、エンハンスト・エイムズ試験（EAT）が推奨されています。DuplexSeq™を当社のBig Blue® TGR機能と併用することで、総合的な検査およびリスク評価戦略を補完することができます。
3. ゲノム安全性による生体内試験プログラムの強化
保存済みの組織（生鮮／凍結DNA）を用いて、既存の生体内試験プログラムにDuplexSeq™変異エンドポイントを追加します。後の慢性安全性試験よりもかなり早い段階でゲノム安全性に関する結果を把握でき、遺伝毒性に関する結果以上の知見を得ることができます。
品質、再現性、そして信頼性
DuplexSeq™は、TwinStrand Biosciences社が開発したデュプレックスシーケンシング技術を採用しており、DNAの両鎖を個別に追跡することでバックグラウンドエラーを排除します。 このエラー訂正アプローチにより、エラー率は従来のNGSにおける約0.1～1％から1,000万分の1未満にまで低減され、標準的なシーケンシングでは不可能な高感度の変異検出が可能になります。 処理施設間で、ほぼ完璧な変異頻度の相関（R ≈ 0.99）が確認されており、施設間の再現性が実証されています。
関連サービス
DuplexSeq™ 変異原性アッセイを以下の手法と組み合わせることで、一貫性のある遺伝毒性戦略を構築します：よくある質問
はい。既存のお客様は、DuplexSeq™ サポートページから、キットマニュアル、i5/i7 インデックスマップ、パネル情報シート、ソフトウェアの変更履歴、製品パンフレット、安全に関する資料など、技術情報や製品に関する追加リソースにアクセスできます。
いいえ。DuplexSeq™は、より広範な遺伝毒性学戦略に、変異の定量的な測定とメカニズムに基づく解釈可能性を加える、補完的なアプローチとして位置づけられるのが最適です。
はい。DuplexSeq™ 変異誘発アッセイは、野生型のげっ歯類組織や、一般的な毒性試験から転用された組織を含む標準的な組織タイプで実施可能です。
本アッセイでは、SNV（一塩基多型）、MNV（多塩基多型）、および短い挿入・欠失を検出しており、サンプルごとの変異頻度が報告されます。
通常はそうではありません。分析とレポートの作成は、Scantoxでホストされている自動化パイプラインを通じて行われます。
はい。DuplexSeq™による変異頻度およびシグネチャの出力結果は、ニトロソアミン不純物に関する研究の解釈を支援し、全体的なリスク評価プログラムの中で変異原性に関する結果を文脈的に捉えるのに役立ちます。
キット：実験室へ試薬を発送し、施設内での実施に向けたプロトコルサポートを提供します。CROサービス：Scantoxは、必要に応じて組織採取を含め、検体受領から最終報告書作成に至るまでの試験全般を実施します。
